夏、商时代 地域处扬州西境。周朝 地属吴、越、楚。秦朝 地属九江郡庐陵县。西汉 地属豫章郡庐陵县、新干县。新朝 地属九江郡桓亭县。东汉 建武元年（25年），桓亭县复名庐陵。三国 地属吴国庐陵郡石阳县、吉阳县。晋朝太康元年（280年），司马炎平吴，庐陵郡治迁石阳，县属沿旧。南朝 梁天监元年（502年），武帝灭齐，高昌县（今吉安县）并入石阳县，隶属庐陵郡，郡县同治所。隋朝 开皇十年（590年），改庐陵郡为吉州，改石阳县为庐陵县。唐朝 武德五年（622年），复置吉州，庐陵仍为附廓县。十国 吴天祐六年（909年），庐陵县属杨吴领地。南唐保大八年（950年），析庐陵水东11乡置吉水县，此为吉水县名之始，盖赣江和恩江在县境交汇，中有沙洲，状若“吉”字。北宋 雍熙元年（984年），析庐陵地置县，仍名吉水。宋至和二年（1055年)），析吉水县置永丰县,以永丰乡得名，皆属吉州。南宋 吉水县，属吉州。元朝 元贞元年（1295年）升州，属吉安路。明朝 复降为县，属吉安府。清朝 吉水县，属吉安府。民国 北洋政府时期，吉水县属庐陵道。国民政府时期，1932年吉水县属第九行政区公署，1939年，改第九行政区为第三行政区。
共和国 1949年-1968年，吉水县隶属于吉安专区。1968年5月，改吉安专区为井冈山地区，1979年7月再度改为吉安地区，2000年撤销吉安地区设立地级吉安市。吉水县今属吉安市。
